研究所自成立以來,取得了一系列重要的研究成果。共獲得國家自然科學二等、三等獎各1次,省部級一等獎3次。有7人先后為國家杰出青年科學基金獲得者,6人為中國科學院“人才計劃或項目人才計劃獲得者,4人獲全國百篇優秀博士論文,2人獲中國科學院優秀博士論文。2000-2008年,科研人員發表各類論文968篇,其中SCI 論文506篇(包括第一作者的有162篇)。人均發表論文連續9年居中科院資源環境類研究所之首(據中國科學院資源環境科學信息中心《中科院資環類研究所論文余引文統計》報告)。截止目前研究所在Nature、SciencePNAS共發表論文9篇,使我所科研人員參加的工作在Nature/Science上發表的文章達到了平均1/年。
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